Comisión Nacional de Derechos Humanos (CNDH) 
El Instituto Mexicano del Seguro Social no ha escatimado esfuerzo para prevenir la emisión de recomendaciones por la Comisión Nacional de los Derechos Humanos, por lo que se ha centrado en realizar las acciones institucionales necesarias orientadas a mantener el correcto ejercicio de la función pública.
Dichas acciones se han visto reflejadas en la atención oportuna y debido seguimiento, hasta su satisfactoria conclusión, de las quejas presentadas ante la CNDH por parte de la población derechohabiente del IMSS; destacando en ese sentido, las brigadas de trabajo semanales que se llevan a cabo en la sede de dicho organismo nacional, en las cuales los abogados de ambas instituciones analizan los diferentes casos, establecen acciones y compromisos para su debida atención y seguimiento, a través del intercambio de criterios y opiniones jurídicas orientadas a dicho fin; asimismo, se celebran reuniones de trabajo con la Primera Visitaduría General de la CNDH, con la finalidad de atender aquellos asuntos de mayor relevancia, con la prioridad y diligencia que requieren estos casos.
En apoyo a lo anterior, se han implementado los mecanismos conducentes a promover el fortalecimiento de las líneas de comunicación institucionales, donde las áreas involucradas en la atención de quejas, asuman los mismos niveles de compromiso requeridos para su adecuada atención, lo que ha permitido mejorar de manera continua y sustentable los distintos servicios médicos brindados por el Instituto.
Comisión Nacional para la Prevención de la Discriminación (CONAPRED)
El Instituto Mexicano del Seguro Social, convencido de la trascendencia social que significa el combate y la eliminación de todas las formas y prácticas de discriminación en nuestro país, trabaja de manera conjunta con el Consejo Nacional para Prevenir la Discriminación, atendiendo de manera oportuna las reclamaciones y quejas que por su conducto son dirigidas al Instituto por parte de su población derechohabiente y de los usuarios del servicio que brinda; para lo cual ha fortalecido la comunicación y coordinación entre ambas instituciones, a través de reuniones de trabajo que se celebran con la Dirección General Adjunta de Reclamaciones y Quejas del Consejo Nacional para Prevenir la Discriminación, con el objeto de intercambiar criterios que permitan atender debidamente sus peticiones y dar cabal cumplimiento a las mismas; destacando la adopción de medidas por parte del Instituto, a fin de prever y garantizar que se realicen conductas que den motivo a reclamaciones y quejas, así como el establecimiento de acciones de comunicación y mejora continua en el servicio que se brinda con las unidades involucradas en los hechos motivo de las reclamaciones y quejas que se presentan ante dicho organismo nacional. Hasta julio del presente año el Consejo Nacional para Prevenir la Discriminación no ha emitido medidas administrativas al Instituto.
